Sistema Avanzado de Cristalografía de Molécula Pequeña

Difracción de monocristal por rayos X para determinar la estructura molecular

XtaLAB Synergy Custom

The XtaLAB Synergy Custom is the fully flexible system for laboratories requiring a bespoke solution for their unique crystallography appli­cations. As its name suggests, you are able to customize to your own design, a system using a range of high quality components dedicated for single crystal X-ray diffraction.

Configuration

The XtaLAB Synergy Custom is where you will find Rigaku’s highest flux FR-X microfocus source delivering 2.5 times higher flux compared to the MicroMax-007 HF rotating anode generator. It may be configured to be dual port to accommodate a second diffractometer, perfect for high-throughput laboratories. It is possible to configure your system with any of Rigaku’s X-ray sources, from micro­focus sealed tubes to rotating anodes, to give the ultimate in flexiblity.

XtaLAB Synergy Custom systems can be configured with the popular and reliable four-circle kappa goniometer which is compatible with a wide range of detectors including the HyPix-6000HE and other Hybrid Photon Counting (HPC) detectors e.g. PILATUS and EIGER detectors.

HPC detectors are close to an ideal detector for a number of reasons:

  • Photon counting detectors that directly detect X-ray photons without the need the intermediate step of converting X-ray photons to light with a phosphor
  • High dynamic range and fast readout speed
  • Extremely low noise
  • An ideal point spread function of a single pixel

These combined features, along with shutterless data collection, means that you can collect more accurate data faster. As a result, the XtaLAB Synergy Custom system offers outstanding performance for single crystal diffraction experiments.

Select your accessories for the XtaLAB Synergy Custom, including the automated sample changing robot, the ACTOR or the XtalCheck for in-situ screening of macromolecules. The extra space around the goniometer enables tools such as a dewar or a microscope to be brought close into the goniometer for speedy mounting of samples.

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Features

  • Recopilación de datos verdadera sin obturador.
  • Detector de ruido extremadamente bajo, permite una mejor medición de los datos débiles.
  • Función de dispersión de punto superior de un píxel.
  • Ánodo rotatorio de alto rendimiento y bajo mantenimiento.
  • Diseño de recinto ergonómico.
  • Goniómetro kappa; goniómetro chi parcial opcional.
  • Crio dispositivos opcionales como Oxford Cryo 800 y Cobra.


HyPix-6000HE: Hybrid photon counting detector



Rigaku Oxford Diffraction now offers the HyPix-6000HE Hybrid Photon Counting (HPC) detector. Like all HPCs, the HyPix-6000HE offers direct X-ray photon counting, single pixel point spread function and extremely low noise. The HyPix-6000HE HPC offers a small pixel size of 100 microns, which allows you to better resolve reflections for long unit cells as well as improving reflection profile analysis. The HyPix-6000HE has a high frame rate of 100 Hz, as well as a unique Zero Dead Time mode providing the ultimate in error-free shutterless data collection.

  • Direct photon counting with no phosphor blooming
  • Single pixel point spread function
  • 100 μm x 100 μm pixel size
  • Extremely low noise
  • Frame rate of 100 Hz
  • Electronically gateable
  • Radiation tolerant design

 

PILATUS3 R 200K: Low maintenance, direct photon counting detector



The PILATUS3 R 200K is a hybrid photon counting (HPC) detector designed to achieve the best possible data quality for diffraction experiments. HPC detectors are direct-detection, single-photon counting devices that have essentially no noise and high sensitivity. Moreover, the high dynamic range excellent DQE characteristics for the PILATUS3 R 200K means that they it is well suited for accurately measuring weak reflections alongside very strong reflections - overload corrections and separate scans for weak and strong data are not necessary. The readout time for the PILATUS3 R 200K is 7 msec readout speed, making it capable of true shutterless data collection, thus removing errors associated with shutter open/close and goniometer start/stop events. HPC detectors have revolutionized the way data are collected at synchrotrons and the PILATUS3 R detectors bring those same capabilities to collect the best possible data at home.
Detector   PILATUS3 R 200K
Active area   83.8 mm x 70.0 mm
Sensor Reverse-biased silicon diode array
Dynamic quantum efficiency (Cu-Kα; Mo-Kα) > 98%; > 76%
Dynamic range 20-bits
Counting rate per pixel 2 x 10⁶ X-ray photons/sec
Readout speed 7 msec
Maximum frame rate 20 Hz
Point-spread function 1 pixel
Cooling Air-cooled
Humidity control Nitrogen or dry air flow
Pixel size 172 μm x 172 μm


PILATUS3 R 300K: Direct photon counting detector with larger active area



The PILATUS3 R 300K is a hybrid photon counting (HPC) detector that is desirable by labs who desire the benefits offered by PILATUS detectors combined with 4-circle goniometers, but prefer a larger active area. HPC detectors are direct-detection, single-photon counting devices that have essentially no noise and high sensitivity. Moreover, the high dynamic range excellent DQE characteristics for the PILATUS3 R 300K means that they it is well suited for accurately measuring weak reflections alongside very strong reflections - overload corrections and separate scans for weak and strong data are not necessary. The readout time for the PILATUS3 R 300K is 7 msec readout speed, making it capable of true shutterless data collection, thus removing errors associated with shutter open/close and goniometer start/stop events. HPC detectors have revolutionized the way data are collected at synchrotrons and the PILATUS3 R detectors bring those same capabilities to collect the best possible data at home.
Detector   PILATUS3 R 300K
Active area   83.8 mm x 106.5 mm
Sensor Reverse-biased silicon diode array
Dynamic quantum efficiency (Cu-Kα; Mo-Kα) > 98%; > 76%
Dynamic range 20-bits
Counting rate per pixel 1 x 10⁷ X-ray photons/sec
Readout speed 7 msec
Maximum frame rate 20 Hz
Point-spread function 1 pixel
Cooling Water-cooled
Humidity control Nitrogen or dry air flow
Pixel size 172 μm x 172 μm

XtaLAB PRO accessories

Description
Oxford Cryo 800

El Oxford Cryostream Cooler: La serie Cryostream 800 es el sistema de baja temperatura a base de nitrógeno líquido más resistente, eficiente y fácil de usar disponible hoy en día. Las características específicas incluyen un sistema de flujo laminar superior, es decir, prácticamente cero riesgo de formación de hielo, extremadamente silencioso y un sistema de inicio rápido que resulta en un tiempo de enfriamiento de 100K de sólo 20 minutos

Notice: New version of CrysAlisPro v38.46 released on 24th January 2017

We welcome user feedback and CrysAlisPro is frequently updated with new features inspired by users. In this way, our software is continually improving so that your system always provides data of the highest quality. Visit our forum for more information.

User-inspired software for superior data quality
Rigaku Oxford Diffraction systems come complete with CrysAlisPro, our user-inspired data collection and data processing software for small molecule and protein crystallography. Designed around an easy-to-use graphical user interface, CrysAlisPro can be operated under fully automatic, semi-automatic or manual control.

How to get CrysAlisPro
The software is freely available for users of Rigaku Oxford Diffraction and can be downloaded from our forum. Please register at http://www.rigakuxrayforum.com. Any queries related to the software may be answered on the forum.

Automatic Crystal Screening

At the heart of CrysAlisPro are the automatic crystal screening, data collection and strategy modules. For a typical crystal, a short pre-experiment lasting less than five minutes is recorded to evaluate crystal quality. From the first frame, CrysAlisPro automatically evaluates the crystal quality and provides the user with information regarding the unit cell, intensity estimation by resolution range and suggested frame exposure times for the full data collection. Additionally, CellCheckCSD (developed with the Cambridge Crystallographic Data Center) helps prevent the collection of known structures by automatically screening the CSD for unit cell matches.

Fastest Strategy Software

CrysAlisPro‘s sophisticated strategy software automatically calculates the optimal conditions for fast, high quality, complete data collection. All strategies are rapidly calculated based on the specific crystal orientation and unit cell. The user has complete control to optimize the strategy for a wide variety of targets including multiplicity, time and resolution. Strategy calculations are extremely fast and efficient, allowing the user to quickly adapt the data collection conditions for a variety of experiment types, with both Mo and Cu radiation.
Automatic and Concurrent Data Reduction

Data reduction and processing initialize automatically with the start of data collection and employ intelligent routines which tune the parameters to give the best data quality. Processed data are always available and accompanied by real time on-screen feedback of data quality and completeness. CrysAlisPro is programmed for multi-core data processing, meaning rapid results even from the largest data sets.

A Full Complement of Crystallographic Tools

In addition to automatic routines, CrysAlisPro includes a very comprehensive and highly effective range of tools and functions for dealing with non-standard and problematic data. These tools are available through the GUI or from a command line interface, and include:

  • Advanced unit cell finding
  • EwaldPro — Reciprocal lattice viewer
  • Twin data processing
  • Incommensurate data processing
  • Automated high pressure data collection and reduction
  • Face-indexing — with automated shape generation
  • Multi-temperature experiments
  • Powder data collection and processing
  • Precession image generation
  • Axial photos

Software Compatibility
Use CrysAlisPro to import and process frames from synchrotrons and other detector formats. Data is automatically output in HKLF format and quick links interface directly to Olex2, CRYSTALS, WinGX and Jana (for use of SHELX, SIR, Superflip and other programs, where installed).


AutoChem

AutoChem is the ultimate productivity tool for chemical crystallography, offering fast, fully automatic structure solution and refinement during data collection. 
Developed exclusively for Rigaku Oxford Diffraction by the authors of Olex2 (Durham University and OlexSys), AutoChem builds upon the success of our original AutoChem software. Seamlessly integrated as an optional plug-in for CrysAlisPro, AutoChem offers an advanced approach for automatic structure determination, with an even higher rate of success.

AutoChem can work with or without a chemical formula, intelligently using multiple solution programs and typically requiring only partial completeness to solve routine structures. In more difficult cases, AutoChem will make attempts in multiple space groups. A number of refinement options are available; atoms are modeled anisotropically where the data supports it and hydrogen atoms are included in calculated geometric positions. The structure is then re-labeled and refined to completion before a final structure report is generated.

CrysAlisPro displays the structure and key refinement parameters, and provides a link to a full Rigaku Oxford Diffraction’s edition of Olex2 — complete with AutoChem plug-in — which can be launched at any time. Here the user can review all aspects of the refinement, step back to any stage of the process and apply changes as necessary.

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XtaLAB P200

Rigaku ofrece el sistema de cristalografía química XtaLAB P200 al cristalógrafo experto en molécula pequeña, donde se requiere una configuración flexible. El XtaLAB P200 representa el sistema de cristalografía química estado del arte con el detector híbrido de píxeles de matriz (HPAD) DECTRIS PILATUS3 R 200K; la misma tecnología CERN utiliza para detectar el supuesto bosón de Higgs. El XtaLAB P200 se puede configurar con radiación de molibdeno (Mo), con radiación de cobre (Cu), o una combinación de las dos. Con un verdadero detector de conteo de fotones, XtaLaB P200 es la elección perfecta de difractómetro de rayos X, tanto para la determinación de estructuras cristalinas de rutina diaria y para los estudios más desafiantes de densidad de electrones de alta resolución.

Goniómetro Kappa

La base fundamental del producto es nuestro goniómetro AFC-Kappa, un diseño que se beneficia de más de cincuenta años de experiencia en ingeniería de precisión. La geometría abierta simplifica enormemente el montaje del cristal, la alineación y el posicionamiento de los dispositivos de baja temperatura mientras que proporciona cobertura superior de espacio recíproco, incluso con equipos terciarios. La rotación libre alrededor del eje Kappa ofrece un posicionamiento más flexible al AFC-Kappa. Sin embargo, dependiendo de sus necesidades, un goniómetro de 4 ejes χ parciales y un goniómetro de 3 ejes χ fijos, están también disponibles.

Elección de fuentes de rayos X disponibles

Junto a la flexibilidad única de este sistema, se incluye la selección de las fuentes de rayos X, que van desde: un tubo sellado de 3 kW de alta frecuencia, a un microfoco de tubo sellado MicroMax™-003, a un microfoco de ánodo rotatorio MicroMax-007 HF de 1.2 kW y el líder de la industria FR-X de 2.97 KW. Las ópticas disponibles van desde un monocromador de grafito tradicional o la óptica de máximo rendimiento SHINE a la óptica de rayos X confocales Varimax™.
Avanzada tecnología de detector híbrido de píxeles de matriz
La tecnología detrás del PILATUS3 R 200K es extremadamente diferente de lo que se utiliza en los detectores CCD y CMOS basados en fósforo. En los detectores basados en fósforo, los rayos X se convierten en luz, que viaja a través de un trozo o cono de vidrio y finalmente, llega a un chip CCD o CMOS donde se acumula hasta la lectura. El paso final en la cadena de procesamiento de señales es una conversión analógica a digital. Cada paso en el proceso de detección aumenta el ruido de la señal y perjudica la capacidad de medir señales débiles.

Con un detector híbrido de píxeles de matriz, los rayos X se miden directamente con un sensor de estado sólido. Cada fotón de rayos X que incide en el detector crea un gran número de pares de hueco de electrón, con la carga que se transfiere directamente al chip CMOS y medido sin la necesidad de conversión de analógico a digital. Los detectores de matriz de píxeles híbridos cuentan con un rango dinámico muy alto, ruido extremadamente bajo, y por lo tanto se logra una óptima relación señal-ruido en un corto tiempo de lectura y alta velocidad de fotogramas.

Los beneficios para el cristalógrafo químico son muy significativos. Las características de bajo nivel de ruido del detector significan que se ha mejorado capacidad de medir con precisión los reflejos débiles. Esto se puede ver en la medición de las reflexiones de mayor resolución para cristales de difracción débil. Un detector PILATUS3 R 200K es el dispositivo perfecto para recolectar de manera óptima difracciones débiles y mejorar el éxito de la resolución de la estructura.

Además de las características sobresalientes de bajo ruido, el PILATUS3 R 200K le permite recolectar datos rápidamente sin tener un impacto negativo en la calidad de los datos. El PILATUS3 R 200K es un dispositivo de conteo de fotones, lo que significa que no se integra fotones antes de la lectura. Esencialmente no hay tiempo muerto durante la lectura por lo que la forma más eficaz de recopilar datos es abrir el obturador, girar el cristal y medir los datos. Cada vez que el obturador se abre y se cierra y cada vez que el eje de oscilación se inicia y se detiene, hay algo de error introducido en los datos. La recopilación de datos sin obturador (Shutterless) elimina los errores, así como la eliminación del tiempo muerto del experimento. El resultado es una mejor calidad de datos en un período de tiempo más corto.

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Features

  • Selección del goniómetro
    • de 4 círculos κ
    • de 4 círculos parciales -χ
    • de 3 círculos fijos -χ
  • Selección de fuentes de rayos X disponibles
    • Tubo sellado de 3 kW
    • Microfoco de tubo sellado
    • Microfoco de ánodo rotatorio de 1.2 kW
    • Ánodo rotatorio de 5.4 kW
    • Microfoco de ánodo rotatorio de 2.97 kW
  • Completa suite de software
    • CrystalClear™
    • Olex2
  • Selección de radiación
    • Molibdeno
    • Cobre

Únicamente disponible en Rigaku, el ACTOR™ opción SM es el único sistema robótico comercial para el manejo automático de cristales para la determinación de estructuras de moléculas pequeñas. El sistema proporciona transporte automático del cristal, centrado y retiro; ofreciendo al usuario un completo funcionamiento desatendido (automático).*

*Cristalografía Química Automática. Amy L. Fuller, Lindesay A. S. Scott-Hayward, Yang Li, Michael Bühl, Alexandra M. Z. Slawin, and J. Derek Woollins. JACS 2010, 132: 5799-5802.

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